布达拉宫12层不让拍照主要是为了保护文物和避免对信仰的侵犯。布达拉宫是藏传佛教的圣地，12层是宫殿中最为神圣的地方，有许多重要的佛像、经文和文物。如果游客随意拍照，可能会对这些文物造成损坏甚至严重损毁，影响文物的价值和保存。此外，拍照也可能对信仰造成冒犯，违背佛教的教义和规定。因此，禁止拍照可以保护文物和信仰，也能让游客更加尊重和理解当地文化。
